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YLPBIdb研究動機
由於分析脂質的技術與基因組學和蛋白質組學相比之下是比較費力的，讓脂質在研究上有了技術的限制，導致脂質與蛋白質間的交互關係遠不及其他類型的分子交互關係研究；現今的技術蓬勃發展，讓脂質學研究的逐漸重視，對於脂質與蛋白質研究的相關資料日益增多，因此我們收集了三篇透過高通量實驗方法的脂質與蛋白質結合關係的實驗數據，經過整理後，建立了YLPBIdb。在這裡我們收集了32個脂質有蛋白質交互影響的數據，我們也提供雙向的搜尋功能，使用者可以搜尋脂質也可以搜尋蛋白質，透過視覺化的資料網路圖，可以清楚的知道脂質與蛋白質的關係，也提供強大的Enrichment分析，讓使用者們可以做進一步基因特徵分析。
資料來源
我們收集了Lu et al.(2012)、Gallego et al.(2010)和Zhu et al.(2001)這三篇文獻的研究結果，分別透過protein microarray和lipid-array方法研究脂質與蛋白質的結合關係，經過整理後總共有
32種脂質與416個蛋白質有結合關係。
YLPBIdb使用介紹
Search Mode
- By Protein Name
在這裡，使用者可以輸入一個蛋白質名稱(e.g. ROM2或YLR371W)
結果我們會列出這個蛋白質的基本資訊，並且會到SGD的summery頁中搜尋是否有與脂質相關的資訊，而且也可以連結到yesatMine的工具，做進一步分析。然後我們會去找出這個蛋白質會結合到哪些脂質，並且還有哪些蛋白質也會分享這些脂質，把結果用一張關係網路圖呈現。最後我們會把上述的蛋白質拿去做YLPBIdb開發的Enrichment 分析，讓使用者可以更清楚有那些生物功能。 結果如下：
- By Lipid Combination
在這裡，我們提供32種脂質給使用者查詢各自結合到的蛋白質群，可以輸入一組任意的脂質組合。參考書入框下方的脂質對應到的代號，且輸入想要搜尋的脂質代號。(e.g. 輸入3U4，就是找PI(4,5)P2和PI(3,4,5)P2各自結合到的蛋白質群的聯集)
結果我們會列出這些脂質分別出自哪篇文獻，然後我們會去找出這些脂質計算出來的蛋白質群，把結果用一張關係網路圖呈現。最後我們會把上述的蛋白質拿去做YLPBIdb開發的Enrichment 分析，讓使用者可以更清楚有那些生物功能。 結果如下：
Browse Mode
- By Protein Name
在這裡，使用者可以看到YLPBIdb裡所有的脂質，並且可以進一步地知道每個脂質有結合到那些蛋白質，最後可以連回YLPBIdb的Search By Protein Name功能，做進一步地分析。
- By Lipid Combination
在這裡，使用可以看到YLPBIdb裡所有與脂質有結合關係的蛋白質，並且我們依照染色體分類。 點進去後，可以看到所屬這段染色體的所有蛋白質與其相關資訊，並且也可以進一步地連回YLPBIdb的Search By Protein Name功能。我們還有繪製一張染色體圖，讓使用者可以更視覺化的了解蛋白質所屬的位置，可以得到與上述相同的資訊和功能。